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Plan du cours
Introduction à Fiji et ImageJ
- Vue d'ensemble de Fiji et de ses applications dans la recherche scientifique
- Comprendre l'architecture et les plugins d'ImageJ
- Installation et configuration de Fiji pour des performances optimales
Techniques de base de traitement d'images
- Formats d'acquisition et d'importation d'images
- Ajustement du contraste, de la luminosité et application de filtres
- Méthodes d'empilement et de projection d'images
Techniques avancées Image Analysis
- Techniques de segmentation : seuillage et détection des contours
- Comptage d'objets et analyse des particules dans les échantillons histologiques
- Mesure des surfaces, des périmètres et d'autres caractéristiques morphologiques
Travailler avec des échantillons logiques Bio
- Traitement d'images de tissus histologiques, de cellules sanguines et d'algues
- Déconvolution des couleurs et analyse des tissus colorés
- Analyse temporelle et suivi du mouvement des cellules
Automatisation et personnalisation
- Création et exécution de macros pour les tâches répétitives
- Utilisation de plugins Fiji pour des analyses spécialisées
- Création de scripts de base avec ImageJ Macro Language (IJM)
Data Management et rapports
- Exportation des résultats et génération de rapports
- Annotation des images et préparation des données pour la publication
- Meilleures pratiques pour une analyse d'image reproductible
Résumé et prochaines étapes
Pré requis
- Compréhension de base des concepts d'imagerie biologique
- Familiarité avec les techniques de microscopie et d'histologie
- Connaissances informatiques de base
Public
- Chercheurs en biotechnologie et en toxicologie environnementale
- Techniciens de laboratoire travaillant avec l'imagerie histologique et cellulaire
- Scientifiques intéressés par l'analyse quantitative des images
14 Heures
